Lo importante a la hora de tratar la ortorexia es determinar cuál es su origen. Para comenzar el tratamiento correcto se van a tener que implicar factores y profesionales de la salud física, pero también mental. Por ello, es muy importante observar todos los rasgos del problema y establecer el inicio del mismo, que muchas veces comienza con elementos obsesivos.
En la mayoría de los casos se sigue un tratamiento multidisciplinar, que cuenta con médicos, nutricionistas y psicólogos, adaptando las pautas a cada caso en concreto. Además, es importante concienciar al paciente de los peligros que este trastorno conlleva, para que, poco a poco, pueda ir cambiando voluntariamente las pautas de su dieta. No solo es importante el tener un buen tratamiento médico, también es necesario un buen apoyo en el entorno familiar y de amistades que rodean a la persona con ortorexia.